某天小天才在回家的路上被不良少女团伙欺负了之后，不良少女把她扔进了下水道里。找不到书包和眼睛的小天才误打误撞进入下水道里的电梯，无意间来到地下的研究室里。刚进入研究室的她就听到了让人绝望的惨叫声，空中还弥漫着烧焦和血的味道。
如果是普通高中生，大概会转头就跑，或者找个角落躲藏起来。但心理扭曲的小天才没有害怕，反倒觉得很兴奋，因为那时候她每天想的就是把父母和不良全杀掉，对杀人这一犯罪行为很感兴趣。
因为四周实在过于黑暗，她扶着墙摸索，不知道过了多久她终于摸到一扇门。当推门而入，正好看到当时时空的实验体攻击实验人员的场景。
满身已经烧焦的看不清面庞的实验体，只能从身体轮廓才能辨认出那是一位男性。抓着其中一个实验人员的脑袋硬生生拧下来后，双手一挥打死了身边另外两个实验人员。
还好屋子里有魔法师，废了一会时间后才把实验体打死。结束后里面 的人才发现小天才站在门外，刚想杀死当时作为一般民众的小天才，她突然兴奋的询问刚刚是怎么回事。
实验人员看到小天才如此奇怪，没有着急杀她，而是把她绑起来后送到了负责人体实验的武野家某一个长老面前。长老觉得小天才很有意思，就把这项自认为跨世纪的改革视线告诉给了小天才，小天才听完后深深陷入了进去，主动要求代替刚刚的实验体进行实验。
在检测完小天才的身体后，实验人员告诉长老小天才有作为实验体的资质。长老看着一脸病态的小天才，认为她应该是现如今最适合的实验体，就同意小天才加入了这项计划。
那时的小天才满脑子都是实验成功后一定要先杀死把自己扔进下水道的那些不良，还有学校里的所有人，包括每日以对小天才施虐为乐的父母。
也许就是有这种执着又疯狂的信念，小天才才能成功。那场实验虽然很勉强，途出也出现了几次失控的现象，但最后还是成功了。
作为第一个实验成功的实验体，不管是武野家还是其他研究人员都很重视小天才，一直把她关在培养仓里禁止外出。而某一次调试的时候，小天才的身体因为操作人员的失误解除了保险，透过骨传音装置整个地下研究室都被小天才的尖叫声不满，而这些研究人员无一例外全部死亡。
地上也因为这股声音受到影响，当地警备队前来调查时才发现这里竟然有一个电梯，进入电梯看到的是所有人都趴在地上，耳朵边都有鲜血。
人体实验自然瞒不住，很快就被大都市知道了。当时大都市因为某件事正受到其他都市市民的舆论，为了防止有更大舆论的发生把其中一个高层派来解决此时。但那个高层看过研究资料后，对这份实验起了兴趣，瞒着大都市偷偷把小天才运到大都市里，又给一大批实验人员洗脑后，重新开始了这个计划。
等小天才再次醒过来的时候，已经不知道换了几次身体了。当时是一位男性站在他面前，并且把她的事情告诉给了小天才。那个男性没有被洗脑，而是单纯的喜欢研究这个实验而已，所以才会加入。
因为男人对小天才的身体感兴趣，所以每天都会来找他下西洋棋。久而久之两人的关系越来越好，小天才也通过男人的口中了解到了外面发生的事情。
男人也是从这一刻开始觉得小天才很可怜，因为他自己有一个女儿，年龄和小天才差不多大。每次看到小天才的时候，他就想到自己的女儿。联想到自己的女儿被关进里面，自己一定会痛不欲生。
但这个时候的小天才身体已经不允许外出了，更别说她的身体离不开营养液。于是男人用自己的方式告诉小天才，让她明白自己并不适合这里，并且自己要给她找到治疗身体的方法。
这时候小天才因为身体和神经的轮换，已经记不起来之前的事情了，所以她选择相信男人的话。这件事不久就被高层知道了，高层派了一个人杀掉男人，但那个人是个名副其实的变态，故意先在小天才面前蹂躏男人，之后一刀结束了他的生命。
看到男人死亡后，小天才的大脑瞬间放空，想起和男人曾经的时光后，她的理智一下子被冲毁。情绪值到达顶点，也就代表了她已经时空。但为了应对这种情况，那个施虐的人早就把传声装置关闭了，还不断在营养液中施加压力，以免出现不测。
但小天才作为管理制作的实验体，本身的战斗能力也很恐怖，甚至凌驾于所有实验体之上。那时她没有哭也没有喊，而是操纵了周围所有带着矿物成分的道具一起射向培养仓外的生命体。不止是虐待男人的凶手，就连其他的实验人员也无一例外全部死亡。
就在那一瞬间，她想起来了为什么自己会在这里，还有父母和不良少女的长相。但距离那次已经过了十年之久，那些可恨之人早就忘了小天才，小天才也不知道他们现在身在何处。但想杀掉她们的愿望和此时无处发泄的心情催使着她行动，小天才满脑子都是离开这里，把那些可恨之人统统杀掉。
可因为自己的身体刚换完，很多地方还没调整好，加上营养液无法给自己恢复体内魔法，十年前的魔法缺失到现在也没补完。刚刚那一攻击几乎已经消耗了她身体里的全部魔法，因为大脑极度缺少魔法的关系，小天才又一次陷入了沉睡。而那些令人可恨的记忆，在同一时间也一起消失了。
第三次醒来就遇到了真礼和悠一，而且一眼就认出了那个熟悉的西洋棋。但她想不起来那是谁的遗物，只知道那是唯一令她在意的东西，所以才会一直爱惜棋盘。
