伊路德、比休梅尔、伊菲美拉、巴佐布、斯诺格、菲亚德拉格和卡内德拉斯，她们被奥特战士打败了之后，最终都在距离她们被打败的地方不远处被发现。然而，赛罗击败格拉尔凡后，却一直没有找到她的下落。
另一边，硅对于那些从异空间涌入这个宇宙的粒子进行的研究，也取得了重大进展。他现在已经成功查明了这些因子中不可分割的基本组成部分。
硅把他的研究成果总结成图表，传送给『佛拉克西纳斯』上的各位。
“就目前来看，那些因子有25种，现在查明已经受到了『魔格之魂』的影响的有：风、火、水、土、光、暗、金、木、超能、神秘、自然、电、冰、龙、战斗、圣灵、混沌和普通，也就是说，剩下的七种：次元、远古、邪灵、自然、神灵、轮回、虫、王，它们所对应的魔王兽，还在这世间游荡着。”
“这些物质之间的反应十分微妙。有些因子在实验室条件下会自动分解，但是在生物体内就会保持稳定。这些因子之间，有些反应很快，有些几乎不反应，但大部分处于平衡状态。以及，在融合之后，虽然变成了新的物质，但是似乎保留了不少反应之前的性质，甚至本来两种物质之间反应速率极快的，都可以融合起来。”只要谈到学术问题，硅就滔滔不绝起来，“但是，似乎这种融合只出现在生物体内，体外合成的话，肯定会分解为融合之前的物质，不管怎么搞都没有用。似乎生物体内有什么机制在阻止它分解。”
“那，我们传送给你的那些视频，你知道那些景象是哪颗星球的吗？”琴里问。
“可以确定是距离地球四光年外的一颗星球的地貌。”硅这才转变话题，“不过在我们已知的全部宇宙中，这颗星球上都不存在生命。不过，你说的那些，比如下氮气雪、氧气雪，三日凌空之类的景象，在那颗星球上都找到了痕迹。不过那种星球很不稳定，很容易被吸入它所在系统中的恒星而毁灭，而这几乎无可避免，因此无法诞生任何生命。”
“不过，有一个宇宙，我们没有去过。”硅话锋一转，“那个宇宙很久以前就已经毁灭了，关于它毁灭的原因，我们猜测过很多可能，大部分研究者认为是自然原因，但我认为，这更有可能是某种宇宙人的行为。同时，我们在那个宇宙附近曾观测到过一个极小的宇宙，那个宇宙只有5千克物质，所以我们认为，什么人用那个宇宙的物质创造了这个小宇宙，那个宇宙才毁灭的。”
这样的对话并未持续多久。因为探测器已经捕捉到了斯考比斯的踪迹。
“做好准备，这次……可是真正的战争了。”琴里说。
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埃及。
“他们每个步骤都在地理跨度如此巨大的地方举行。”汞说，“这对于迎接外星人没什么用吧？”
“不排除他们在故意躲着我们或者其他人的可能。”魔格大蛇说。
然而，还没等他们找到地球三体组织，他们面前的沙丘却突然开始晃动，紧接着一角超兽巴克西姆就从沙丘中冲出来，巨量的沙粒差点淹没地面上的各位。
巴克西姆俯下身子，将角当做导弹发射出去，好像是为了消灭了什么怪兽似的。这时，巴克西姆才注意到魔王兽他们，变成人类的模样。
“亚波人？她为什么会来？”魔格大蛇问。
“大概是……你们为什么来，她就为什么来！”巴克西姆回答。
远处的似乎是城市的地方发出爆炸声。
“贝劳克恩开始行动了！”巴克西姆说着，变回怪兽的模样，飞向城市。
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据估计，斯考比斯会在它们之前在高斯奥特曼的宇宙出现的地方登陆。奥特战士们提前来到这里。威特队也探测到了怪兽，开始在市区内安装攻击装置，并进入战备状态。
赛罗在海边的沙滩上等待。因为『佛拉克西纳斯』在这里还探测到了其他巨大生物的反应，所以赛罗和捷德留在这里，以应对可能突如其来的灾害，其他人则进入海洋，寻找这些巨大生物。
奥特战士就算在人类形态，也能够在海底自如移动。
艾克斯并没有找到怪兽，但是，她们却意外发现了一个蓝洞——而且是人工穿凿的蓝洞。维克特利试着发出『维克特利姆灼烧』，但这似乎并不能破坏蓝洞的外壁。『银河水晶』的光足够照亮蓝洞。她们往里游，蓝洞的四壁绘有图画，看上去很像是什么人战斗的场景——古代绘画看不出画的是谁很正常。然而，洞的尽头却是一面石壁。艾克斯已经录下了她们看到的景色，打算离开这里。
然而，她们刚要离开蓝洞，前面就射来一道光，为了避免被发现，她们沉到蓝洞的底部。
“那是……威特队的潜艇？”欧布认出了潜艇上的文字。潜艇的探照灯照下来，欧布赶紧躲开。然而，银河却看到了潜艇里的人。
“他们几个果然来了。”银河感慨道。
“没错了，《太平风土记》里的蓝洞就是这个。”松户森说。
随着探照灯在壁画上四处扫视，上面的内容足以使他们确定此次会发生的事。
艾克斯偷偷地听着。松户森说：“《太平风土记》记载，海神的使者联合巨人，与天空的魔虫战斗。”
“但是……巨人是奥特战士的话，海神的使者又是……”
奈绪美还没有说完，潜艇就被什么东西抓住。涩川一彻连忙打开潜艇外的摄像机，确实拍到了怪兽。那是一只鳐鱼型的怪兽。这时，它似乎受到了什么人的攻击，转头向洞外游去。待潜艇恢复后，他们立刻向洞外驶去。
艾克斯的数据库中，记录了这种叫做雷迦的鳐鱼怪兽。她利用『虚拟艾雷王装甲』放出的雷电吸引它游出蓝洞。
然而，洞外却聚集了无数的雷迦，它们把银河、维克特利、艾克斯和欧布包围起来。
而在海滩上。
“斯考比斯就要落地了。”令音通知赛罗和捷德。
很快，天空中就出现了许多小点，它们逐渐靠近，渐渐可以看出怪兽的模样。
海底，雷迦群似乎受到了什么的感召，集体向海面游去。她们感觉不妙，立刻变身跟着它们飞出海面。
威特队安装的攻击装置开始运作，但是斯考比斯却根本就不在乎，喷出红色破坏光弹，瞬间将它们全部摧毁。赛罗奥特曼似乎注意到这些装置在被毁掉时有一些异常，但是也没有深究，转而发射『赛罗集束光线』消灭斯考比斯。捷德奥特曼则挥舞『终极升华器』将斯考比斯斩成两半。
银河奥特曼、维克特利奥特曼、艾克斯奥特曼和欧布奥特曼从水中冲出来，发射各自的光线消灭斯考比斯，然后降落在海滩上。但是，斯考比斯太多，他们完全不可能把它们立刻全部消灭掉。
此刻雷迦就出现的特别及时。它们在空气中飞舞，喷出破坏光弹，竟一击消灭了斯考比斯。大部分斯考比斯都去追逐它们了，只留下六只在地球上。
佛拉克西纳斯则展开『世界树之叶』，作为支援奥特战士和雷迦的装备，同时也在探测圣德罗斯的踪迹。
赛罗奥特曼抓住斯考比斯的尾巴，猛地把它甩开，变成月神奇迹形态，控制头镖飞快地斩击斯考比斯，接着召唤出『奥特长矛』，飞快冲向斯考比斯，把它刺穿。
银河奥特曼展开结界，抵挡斯考比斯的红色光弹，慢慢地向斯考比斯靠近，到了一定距离后，一拳击中它的胸甲，抓住它挥舞来的利爪，猛劈它的脖子，待斯考比斯后退，以『银河十字光线』消灭它。
维克特利奥特曼不断地发射『维克特利姆斩击』，打得斯考比斯连连后退，用『EX雷德王重拳』猛击斯考比斯，最后一拳把它打爆。
艾克斯奥特曼装备上『虚拟芝顿武铠甲，挡住斯考比斯和破坏光弹，发动『芝顿龙卷风』，把斯考比斯洞穿。
捷德奥特曼挥舞着『终极升华器』，以极快的速度旋转、斩击，立刻消灭了斯考比斯。
欧布奥特曼发动『欧布地之剑』，光线击中斯考比斯，激起浓烟。斯考比斯妄图飞走，却被欧布奥特曼抛来的『三重光轮』切割成两半，在空中爆炸。
“报告，到达地球上的斯考比斯，全部被消灭。”
然而，浓重的黑雾突然弥漫了整个海滩。自律摄像机失去了信号，同时强烈的生命反应出现。
“可恶！”琴里看着雪花的屏幕，“居然来这招！”
奥特战士们觉得事情不妙，变为人类的形态，在黑暗中寻找敌人。
突然，一道镰刀从黑影中闪现，把『终极升华器』打落，同时切割维克特利，『终极升华器』则消失在黑暗中。赛罗四下寻找，突然被火焰攻击，她立刻向那个方向扔去头镖，然而头镖却从另一个方向飞回来，同时银河和艾克斯被攻击。欧布挥动圆锯挡住镰刀，却反被火焰攻击。她们警惕的聚拢起来。然而，密集的火焰从四面八方射来，夹杂和破坏光弹和念力攻击。很快，她们的计时器就开始闪烁。赛罗支撑着站起来，变成闪耀形态驱散黑雾。她们却惊讶的发现，所有建筑都变成了沙子！
攻击再次袭来，奥特战士们被打得无力还击。这时，幕后黑手才出现。
那便是圣德罗斯，以人类的模样。
“结束了。”
圣德罗斯冷漠地说，随即一挥镰刀。
奥特战士消失了。
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回到埃及。
贝劳克恩追逐着一辆白色的货车，发射导弹攻击货车。货车在错综复杂的街道里行驶，希望摆脱贝劳克恩，哪想德拉格里突然出现，喷出雷电把货车掀翻。
铜立刻把货车门撕开，驾驶员想要逃跑，却被亚波人抓住了。
“跟我走，否则……”亚波人露出阴险的笑容，手里的破坏光弹已经箭在弦上。
